קידום קשרי המחקר הבינלאומיים של ישראל הינו אחד היעדים המרכזיים בהפיכת מערכת ההשכלה הגבוהה של ישראל לאיכותית ותחרותית ברמה בינלאומית. כיום קיימים שיתופי פעולה משמעותיים דרך הסכמים בילטראלים ומולטילטראלים בין מוסדות וארגונים שכוללים קרנות מחקר משותפות, פרויקטים, חילופי חוקרים וסגל ועוד.
המל"ג פועלת לטובת המשך קיומם של הסכמים אלו והרחבתם, ולטובת יצירת שותפויות חדשות נוספות. שיתופי הפעולה המרכזיים של ישראל כיום:
קרן מו"פ אירופי
תכניות המסגרת למחקר ופיתוח של האיחוד האירופי הן התכניות הגדולות ביותר בעולם לשיתוף פעולה מדעי ותעשייתי, ומהוות גורם מימון מרכזי. התכנית הנוכחית היא Horizon2020, המעניקה מימון ליצירת קונסורציום שותפים, לפעילות מחקר ופיתוח של התעשייה, האקדמיה, מכוני מחקר, ארגונים ציבוריים ופרטיים. השתתפות מדינת ישראל בתכנית מנוהלת ע”י ISERD.
קרן המחקר ארה”ב ישראל – BSF
הקרן הוקמה בשנת 1972 מכח הסכם בין ארה"ב וישראל במטרה לקדם שיתוף פעולה מדעי בין המדינות באמצעות תמיכה במחקרים משותפים של חוקרים ישראליים ואמריקאים במגוון תחומים. הקרן מפעילה מספר מסלולים של מענקי מחקר ומספר תכניות של פרסים אקדמיים.
ב-2013 החלה לפעול במסגרת הקרן תכנית לשיתוף פעולה עם ה-NSF האמריקאית. התכנית מקבלת מימון מות"ת ומה-NSF לטובת חוקרים ישראלים ואמריקאים הלוקחים בה חלק.
קרן המחקר גרמניה ישראל – GIF
קרן GIF הוקמה בשנת 1986 במסגרת הסכם בין ישראל לגרמניה, במטרה לממן מענקי מחקר משותפים, לקבוצות מחקר מהאוניברסיטאות, בתי החולים ומוסדות ההשכלה הגבוהה משתי המדינות. הקרן מעורבת במחקר ממגוון תחומים: מדעי החיים והרפואה, מדעים מדויקים, חקלאות, איכות הסביבה, מדעי החברה ומדעי הרוח.
קרן המחקר ישראל סין ISF-NSFC
קרן משותפת לקידום ומימון מחקרים מדעיים משותפים, אשר מנוהלת וממומנת במשותף ע”י הקרן הלאומית הסינית למדעי הטבע (NSFC) והקרן הלאומית למדע (ISF). הקרן החלה לפעול בשנת , 2014 ובמסגרתה ממומנים מענקי מחקר וסדנאות מחקר משותפים בין שתי המדינות.
קרן המחקר ישראל הודו ISF-UGC
קרן משותפת לקידום ומימון מחקרים מדעיים משותפים, אשר מנוהלת וממומנת במשותף ע”י המועצה למענקים אוניברסיטאיים (UGC –מטעם ממשלת הודו) והקרן הלאומית למדע (ISF). הקרן החלה לפעול בשנה”ל 2015, ובמסגרה ממומנים מענקי מחקר וסדנאות מחקר משותפים בין שתי המדינות.
קרן המחקר ישראל סינגפור ISF-NRF
קרן מושתפת לקידום ומימון מחקרים מדעיים משותפים, אשר מנוהלת וממומנת במשותף ע”י הקרן הלאומית למחקר בסינגפור (NRF) והקרן הלאומית למדע (ISF). הקרן החלה לפעול בשנת 2017, ובמסגרתה ממומנים מענקי מחקר משותפים בין שתי המדינות בתחומי מדעי הטבע וההנדסה.
תוכניות לימוד 
החלטות מל”ג/ות”ת 
