בשנת 2002 החליטה המועצה להשכלה גבוהה (מל"ג) על הקמת מערכת להערכת איכות והבטחתה במוסדות להשכלה גבוהה בישראל, במטרה לשמר ולטפח את איכות המוסדות ותוכניות הלימודים. המל"ג ראתה בקיומה של מערכת זו מרכיב חיוני לשימור ולקידום איכות ההשכלה הגבוהה בישראל. תובנה זו קיבלה משנה תוקף לאור המגמה העולמית המקדמת את נושא הערכת איכות והבטחתה במוסדות להשכלה גבוהה. מספר לא מבוטל של מדינות הקימו ארגונים (רבים מהם נוסדו לפי חוק) שהופקדו על נושא זה, וכן הוקמו סוכנויות בינלאומיות לתכלול התחום. לפיכך, קידום הערכת איכות והבטחתה במוסדות להשכלה גבוהה בישראל, מעבר ליתרונות הגלומים בו, הפך חיוני להמשך שילובה של המערכת האקדמית הישראלית ברשת האקדמית העולמית.

היחידה להערכת איכות (QAU) - Quality Assurance Unit הוקמה בשנת 2004 במסגרת מזכירות המל"ג, וכן מונתה ועדת משנה להבטחת איכות. בשנת 2010 הפכה היחידה לאגף נפרד במל"ג (QAD) - Quality Assurance Division